Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms