Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms