Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf70Q9BSU1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C16orf70Q9BSU1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms