Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms