Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX22Q96L94 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms