Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms