Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms