Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms