Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms