Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX40

TMEM107, Transmembrane protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM107Q6UX40 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM107Q6UX40 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM107Q6UX40 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms