Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms