Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC144NLQ6NUI1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC144NLQ6NUI1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms