Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNT1Q5JUK3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms