Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD3Q5JSP0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms