Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q56UQ5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q56UQ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q56UQ5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q56UQ5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q56UQ5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms