Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms