Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms