Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms