Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HADHQ16836 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HADHQ16836 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HADHQ16836 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HADHQ16836 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHQ16836 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHQ16836 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHQ16836 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHQ16836 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHQ16836 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHQ16836 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HADHQ16836 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHQ16836 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHQ16836 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHQ16836 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHQ16836 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHQ16836 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHQ16836 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHQ16836 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HADHQ16836 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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