Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms