Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP1Q15431 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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