Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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