Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3GAP1Q15042 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3GAP1Q15042 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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