Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSHL1Q14406 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSHL1Q14406 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms