Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX2Q13950 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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