Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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