Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCOA4Q13772 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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NCOA4Q13772 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCOA4Q13772 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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