Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALCAMQ13740 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ALCAMQ13740 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ALCAMQ13740 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALCAMQ13740 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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