Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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