Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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