Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXO1Q12778 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms