Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB4BP68371 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms