Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP4BP1P59074 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms