Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORCP51449 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORCP51449 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RORCP51449 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms