Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MRE11P49959 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRE11P49959 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRE11P49959 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRE11P49959 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRE11P49959 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MRE11P49959 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRE11P49959 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRE11P49959 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRE11P49959 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRE11P49959 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms