Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITPNBP48739 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms