Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME1P48163 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME1P48163 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME1P48163 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME1P48163 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME1P48163 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms