Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms