Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms