Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PEX2P28328 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms