Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms