Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRR1P24046 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms