Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB5AP20339 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms