Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN2P17655 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms