Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD44P16070 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD44P16070 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD44P16070 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD44P16070 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD44P16070 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD44P16070 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms