Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms