Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF888P0CJ79 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms