Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINA1P01009 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms