Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms