Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNAPINO95295 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms